El examen se puede realizar para determinar la causa de la vaginitis o inflamación en la mucosa vaginal que ocasionalmente puede comprometer la vulva y cuya etiología puede ser de origen infeccioso o no. Dentro de los principales agentes infecciosos se encuentra Trichomonas vaginalis y Candida albicans.
Además, se puede determinar la causa de una vaginosis o alteración de la microbiota vaginal, en la que la flora bacteriana normal, constituida por bacilos Gram positivo (Lactobacillus spp.), se haya sustituida por cocobacilos Gram negativo (Gardnerella vaginalis) y una microbiota variada que comprende diversas especies anaerobias.
La interpretación de los criterios de Nugent está basada en la puntuación final, luego de sumar las cruces de los morfotipos de las bacterias presentes: 0 a 3 se considera microbiota normal; 4 a 6 puntos se considera microbiota intermedia o mixta; 7 a 10 puntos es diagnóstico de vaginosis bacteriana.
Este examen también se usa para la determinación de infecciones de transmisión sexual como la tricomoniasis.

Se recomienda evitar el uso de antibióticos al menos 5 días antes de la recolección de la muestra. Sin embargo, criterio médico puede modificar este requisito. La muestra debe ser tomada por el ginecólogo. Se requiere de dos hisopos secos, sin medio de transporte.

El hisopo con medio de transporte sólo se puede utilizar para realizar el gram y no el examen directo. Por este motivo sólo se aceptan hisopos secos, sin medio de transporte.

Hisopo estéril para la recolección de la muestra. El hisopo debe ser seco, sin medio de transporte.

Exudado vaginal, Flujo vaginal

TA: (20-25) °C
El directo se debe realizar de forma inmediata. Para realizar el gram: 4 horas.

R: (2-8) °C
Inaceptable

C: -15 °C
Inaceptable

Muestras tomadas en hisopos con medio de transporte. Muestras refrigeradas o congeladas. Muestra insuficiente, muestra en recipiente no estéril, muestra derramada o contaminada.